Discriminación social, económico, cultural, y politica existe en cada país.

Los sistemas nacionales han fallado en reconocer tradiciones indígenas, y por ello son excluidos de muchas partes del sistema legal.

Pocos estados reconocen los derechos de los indígenas y sus territorios.

El acceso a la educación y salud es limitado. Con la pobreza de la mayoría de los indígenas, no tienen suficiente para pagar los costes de la escuela, transporte, libros, y uniformes.

Otro problema con el sistema de educación es que la lengua de instrucción no es indígena. También no tienen suficiente dinero para recibir atención medica.

El resultado es altos niveles de analfabetismo y deficiencia en el sector de salud.
Las relaciones entre los indígenas y los gobiernos de sus naciones son inestables por otras razones también. Muchos gobiernos tienen politícas integracionistas, pero al mismo tiempo existe discriminación racial y hay una falta de participación democratica.

Estos factores sirven a poner los indígenas en una situación de desventaja perpetual, que pone ellos en el fondo de las economias nacionales.

Un ejemplo de la marginalización de los indígenas ocurrió en Perú. En la constitución de 1993 el gobierno de Fujimori abolió los protecciónes legales para los indígenas porque pensó que los problemas de los indígenas necesitaban ser resueltos en el modelo economico liberal. Sus territorios fueron abiertos para la expansión de los negocios y no tuvieron estrategias legales para defenderlos.

La situación de los indígenas es peor para los mujeres indígenas. Las mujeres indígenas encuentran más discriminación porque son indígenas y mujeres, tienen pocas oportunidades de participar en las decisiones que les afectan . Otra problema es que reciben menos educación que hombres. Por esta razón muchas mujeres indígenas están en el fondo de sociedad en terminos de educación.

La pobreza es una problema para muchos personas en latinoamérica y no solamente los indígenas. En Bolivia, la mitad de la población vive en pobreza y 64% de la población indígena es debajo del linea de pobreza. Se considera debajo del linea de pobreza si su ingreso es menos de dos dolares por día. El 79% de la población indígena esta debajo de dicha línea .